En 1544, au moment où il écrit à Xavier, Favre était de retour à Cologne, où le pape l'avait rappelé à la demande du nonce Poggio. Tout occupé à conforter le clergé, les étudiants et les bourgeois dans la lutte contre les luthériens, il maintenait la ville dans la foi traditionnelle par ses prédications en latin, les Exercices et les lettres qu'il adressait à la cour impériale. Il y fonda aussi une communauté de jésuites, qui comptait en mai huit confrères. En juillet de la même année, à la demande d'Ignace, il partira de nouveau pour le Portugal. A la même époque, Xavier missionnait dans la région de Cochin, Ceylan et Tuticorin. Les deux lettres que Favre lui avait adressées en janvier et juillet 1544 ne sont jamais arrivées à destination. La première avait été envoyée à Lisbonne, d'où les Pères Criminalis et Lopes, en partance pour les Indes, devaient l'emporter. Mais leur navire avait dû rebrousser chemin. Quant à la lettre du mois de juillet, elle était arrivée trop tard, après l'appareillage de la flotte. Favre, qui se trouvait à Lisbonne le 24 août 1544, reprit possession de ses lettres et les emporta avec lui jusqu'à Rome, où elles furent retrouvées dans les archives de la Compagnie. Ces deux lettres (traduites par Pierre Emonet) comblent partiellement une lacune du Mémorial de Pierre Favre de l'année 1544, à laquelle seuls deux courts paragraphes font allusion. On peut lire d'autres lettres inédites de Favre dans Christus : n" 22, avril 1959 (pp. 240-252) etn" 177, janvier 1998 (pp. 98-105).
Cologne, le 24 janvier 1544
La grâce et la paix de Jésus Christ Notre Seigneur soit toujours dans nos âmes.
Vous aurez appris
Cologne, le 24 janvier 1544
La grâce et la paix de Jésus Christ Notre Seigneur soit toujours dans nos âmes.
Vous aurez appris